یکی از جنبه‌های مهم و برجسته در حوزه همکاری‌های بین‌المللی علم و فناوری، همکاری‌های دوجانبه است که این امر در قالب محورهای زیر در این گروه پیگیری می‌شود:
برقراری و گسترش روابط جدید دوجانبه در سطح کشورهای همسایه، منطقه‌ای و بین‌المللی با هدف ایجاد زیرساخت برای همکاری‌های علمی و فناورانه؛
توسعه تعاملات با وزارت امور خارجه با استفاده از ظرفیت های نمایندگی ها و سفارت‌خانه های خارج از کشور؛
رصد نشست‌ها، همایش‌ها و کنفرانس‌های فناورانه و نوآورانه داخل و خارج کشور درخصوص شبکه‌سازی و توسعه روابط خارجی؛
مشارکت فعال در کمیسیون‌ها و کمیته‌های همکاری‌های مشترک از طریق شناسایی و برقراری ارتباط با وزارتخانه‌های متولی کمیسیون مشترک با کشورها و پایش مستمر وضعیت کمیسیون‌ها.
